Xã Yên Thế là đơn vị hành chính mới được thành lập từ ngày 1/7/2025 trên cơ sở sáp nhập 5 đơn vị hành chính: xã Tân Hiệp, xã Đồng Tâm, xã Đồng Lạc, xã Tân Sỏi và thị trấn Phồn Xương, theo Nghị quyết số 1658/NQ-UBTVQH15 ngày 16/6/2025 của Ủy ban Thường vụ Quốc hội khóa XV về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã của tỉnh Bắc Ninh năm 2025. Sau khi sắp xếp, xã Yên Thế mới gồm có 50 thôn, bản, tổ dân phố, phân bố trên địa bàn rộng lớn: 43,6 km2, dân số 30.900 người.